[2010.09.20] chromeのバージョンアップにより、wmodeによってはpopupが開かなくなったり（参考記事）と、状況が変わってます。これは当時の記事なので現状と違う部分があります。すみません。
先日公開してみたURLOpener、ブラウザの挙動のあまりの違いに落としどころがわからなくなっていましたがまとまりました。
当初はJSでwindow.openを呼んだ時の動きに合わせる！と思っていましたが、別にそんな必要ないなと。
使う側になってみて考えて、とりあえずよく使う機能を楽に使えればいいや、と切り替えました。
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